- 讲师:刘萍萍 / 谢楠
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【摘要】 目的 用实时荧光定量RT-PCR的方法测定PBC患者外周血中GNLY的基因表达水平,探讨GNLY在原发性胆汁性肝硬化(PBC)的表达及意义。 方法 采用Taqman探针技术,以18sRNA为内对照,测定了60例PBC性心脏病患者外周血中GNLY mRNA的含量,以健康对照组为对照。结果 GNLY mRNA在60例PBC患者的表达范围为5.35×107~4.61×109拷贝/μg RNA,均值为(2.7±2.5)×108拷贝/μg RNA;100例健康对照者均值为(3.0±1.9)×107拷贝/μg RNA。PBC组GNLY mRNA的含量显著高于疾病对照乙型肝炎肝硬化组和健康对照组(P< 0.01)。结论 通过FQ-PCR方法检测出PBC患者GNLY mRNA的含量显著高于健康对照组,GNLY表达与PBC的发生发展存在一定的关联性。
【关键词】 PBC; GNLY;逆转录-聚合酶链反应
原发性胆汁性肝硬化(primary biliary cirrhosis,PBC)是一种原因不明的自身免疫性肝病,胆小管出现进行性破坏性炎症反应,肝内出现慢性胆汁淤积,进一步发展成肝纤维化和肝硬化,最终患者只能依靠肝移植免于死亡[1]。PBC患者胆管破坏伴随着门脉淋巴细胞浸润,主要为活化的CD8+T和CD4+T细胞,CD8+T细胞介导的免疫反应参与PBC中胆管上皮细胞和肝细胞破坏的发病过程[2]。颗粒溶素(granulysin,GNLY)是NK(natural killer,NK)细胞和细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表达的一种溶细胞分子,在机体免疫应答过程中,它先通过胞吐作用从胞浆颗粒中排出,然后在胞外发挥其细胞毒作用[3]。本研究主要是利用实时荧光定量RT-PCR的技术,建立一种灵敏快速地检测GNLY 基因表达的方法,并从分子水平探讨GNLY mRNA 在PBC患者外周血中的表达及临床意义。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 研究对象 60例经临床确诊的PBC患者均为长征医院住院病人,其诊断均符合美国肝病学会(AASLD)2000年推荐的PBC诊断标准[4],其中男5例,女55例,男女比例为1:11,发病年龄(45.6±10.2)岁。正常对照组为100例健康体检者。
1.1.2 主要仪器和试剂 RNeasy Mini Kit(QIAGEN),Taqman Reverse Transcription Regents (Applied Biosystem),淋巴细胞分离液(上海生化试剂公司), TaqMan 2×PCR Master Mix,Taqman Reverse Transcription Regents (Applied Biosystem),引物及TaqMan水解探针的合成(上海生工)、DNA测序分析(上海联合基因生物技术公司)。GeneAmp 7900 Sequence Detection Systems(美国PE Biosystems公司)。
1.1.3 引物、探针的设计与合成 用Beacon Designer 2.1软件设计GNLY和18s rRNA的基因专一性的引物和探针,GNLY上游引物:5'ACT GAA GAA GAT GGT GGA TAA GCC 3';下游引物:5'GCC CTG GGT AAC TCT AGA CTG A3';探针: FAM CGG AAC CTC CAG TCA GAA GAC CAG A TAMRA。内参18s rRNA上游引物:5' ACA TCC AAG GAA GGC AGC AG 3';下游引物:5'TTC GTC ACT ACC TCC CCG G 3';探针:FAM CG CGC AAA TTA CCC ACT CCC GA TAMRA。正反向引物、Taqman探针(FAM TAMRA标记)均由上海生工生物技术公司合成。
1.2 实验方法
1.2.1 抽提外周血单个核细胞和总RNA 取枸橼酸钠抗凝静脉血5ml,用淋巴细胞分离液得到PBMC,QIAGEN试剂盒提取细胞总RNA,通过1%琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度仪检测所提取的总RNA的质量和浓度,并计算RNA的含量。
1.2.2 cDNA的合成 反转录按试剂说明书操作,反转录体系如下:RNA 2.85μl, 10×Taqman RT Buffer 1.0μl,40mM Magnesium Chloride 2.2μl,deoxyNTPS Mixture 2.0μl,Random Hexamers 0.5μl, RNAase Inhibitor 0.2μl, MultiScribe Reverse 0.25μl, Transcriptase RNase-free water 1.0μl ,共10μl的反转录体系,42℃45min → 94℃3min终止反应。cDNA保存于-20℃备用。
1.2.3 定量阳性模板和内参照模板的制备 PCR反应体系如下:蒸馏水 34.7μl,10×Ex buffer 5μl,ExTaq酶0.3μl,dNTP 4μl,上下游引物各2μl,cDNA 2 μl, GNLY和18s rRNA的PCR产物进行1.5%琼脂糖凝胶电泳,切胶回收纯化,将纯化的PCR产物与pMD18-T载体进行连接构建重组质粒pMD18-T-GNLY和pMD18-T18s rRNA进行酶切及测序鉴定。
1.2.4 绘制标准曲线 将质粒pMD18-T-GNLY和pMD18-T-18s rRNA经紫外分光光度仪测定浓度换算出拷贝数,用TE缓冲液以1:10比例稀释成各种不同拷贝数浓度。上述不同稀释度的两种标准模板1μl,2×buffer 5μl , GNLY或18s rRNA上、下游引物各0.2μl, Taqman探针0.2μl,无RNA酶水3.4μl,共10μl反应体系。扩增条件均为50℃ 2min;95℃ 10min;95℃ 15s,60℃ 1min 40个循环。反应结束后计算机自动绘制出GNLY和内参18s rRNA的标准曲线。
1.2.5 定量PCR检测GNLY的表达 将阳性模板、患者和对照组的cDNA在GeneAmp 7900上进行扩增。反应结束后,PCR仪自动计算出各样本GNLY基因的拷贝数。
1.2.6 统计学处理 计量资料用x±s表示,多组资料之间比较用方差分析,两组之间比较采用t检验。
责编:杨盛昌
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