生物信息学_计算表观遗传学

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• 1下列关于DNA甲基化的说法正确的是

  A.DNA甲基化主要发生在CpG二核苷酸中胞嘧啶的第五位碳原子上

  B.CpG岛不受甲基化

  C.DNA甲基化仅限于CpG环境中

  D.只有哺乳动物基因组有DNA甲基化

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• 2下列关于CpG岛的说法正确的是

  A.CpG岛就是CpG双核苷酸聚集的区域

  B.CpG岛不受甲基化

  C.CpG岛甲基化抑制下游基因的转录

  D.CpG岛易受突变的影响

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• 3下列关于CpG岛的说法不正确的是

  A.CpG岛的定义不唯一

  B.CpG岛是甲基化可变区

  C.CpG岛尚无有效的定义

  D.CpG岛的特定的定义很难适应各个物种

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• 4下列算法不是CpG岛预测算法的是

  A.CpGcluster

  B.CpGProD

  C.CpG_MI

  D.CpGfinder

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• 5基于窗口滑动法的CpG岛预测的缺点不包括

  A.CPG岛的起始点一般不是CPG双核苷酸

  B.识别的CPG岛的数目较多

  C.预测和筛选过程依赖于相同的参数

  D.多阈值的使用使得参数空间变得很大

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• 6CpG岛预测算法难以克服的一个缺陷是

  A.预测的CpG岛不从CpG开始

  B.排除Alu重复元件

  C.阈值过于任意

  D.适合所有物种

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• 7CpGcluster预测CpG岛的基本假设是

  A.CpG岛二核苷酸之间距离的背景分布是几何分布

  B.CpG岛二核苷酸之间距离的背景分布是二项分布

  C.CpG岛二核苷酸之间距离的背景分布是负二项分布

  D.比随机出现CpG二核苷酸之间距离更短的CpG簇即CpG岛

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• 8较好的预测CpG岛的方法不需要考虑的因素是

  A.需要依赖于传统的CpG岛阈值

  B.考虑到CpG岛的异质性

  C.考虑DNA甲基化状态

  D.提高运行效率

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• 9下列关于重亚硫酸实验的说法不正确的是

  A.重亚硫酸盐转化的DNA在经过PCR扩增后得以转变为鸟嘧啶

  B.重亚硫酸盐会将非甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶，而使甲基化的胞嘧啶保持不变

  C.重亚硫酸钠可以把非甲基化的胞嘧啶C转化为尿嘧啶U，再经过PCR扩增克隆变成胸腺嘧啶T产生T：A配对

  D.通过重亚硫酸钠的处理，甲基化状态不同的DNA序列片段就转化为有碱基差异的序列片段，这种差异可以进一步用DNA测序的方法进行测定

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• 10下列关于限制性内切酶法的说法不正确的是

  A.HpaⅡ受甲基化的胞嘧啶的阻碍较大，任何胞嘧啶的甲基化均会阻碍它的切割，而MspⅠ只会受到CpG环境外的胞嘧啶甲基化的阻碍

  B.McrBC能对DNA的非甲基化位点进行识别而切割，从而得到非甲基化的序列片段

  C.通过限制性内切酶特异性地将基因组DNA切割为甲基化和非甲基化的序列片段是发现功能CpG岛的重要手段

  D.最常用的限制性酶是HpaⅡ和MspⅠ

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