PAM250矩阵定义的进化距离为两同源序列在给定的时间有多少百分比的氨基酸发生改变

试卷相关题目

• 1根据PAM打分矩阵，下列哪个氨基酸最不容易突变

  A.丙氨酸

  B.谷氨酷胺

  C.甲硫氨酸

  D.半胱氨酸

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• 2直系同源物定义为

  A.不同物种中具有共同祖先的同源序列

  B.具有较小的氨基酸一致性但是有较大的结构相似性的同源序列

  C.同一物种中由基因复制产生的同源序列

  D.同一物种中具有相似并且通常是冗余的功能的同源序列

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• 3病毒在进化研究中很重要，下列选项中错误的是

  A.病毒经常处于强大的选择压力下

  B.高突变率，许多病毒的复制速度也是极其惊人

  C.病毒基因组的进化速度没有其他细胞的基因组快

  D.病毒生命力是很脆弱的，对复杂环境要求很高

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• 4有两个最基本的构建系统发生树的方法：基于距离的和基于字母特征的方法。它们之间的基本差异是

  A.基于距离的方法含有一个用于定义分支顺序的中间数据矩阵，而基于字母特征的方法却没有

  B.基于距离的方法只应用于DNA的数据，而基于字母特征的方法可以应用于DNA或者蛋白质数据

  C.基于距离的方法利用简约算法而基于字母特征的方法却没有

  D.基于距离的方法所产生的进化分支与进化时间长短成比例，而基于字母特征的方法却没有

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• 5下列哪一个是基于字母特征的系统发生分析的算法

  A.Kimura算法

  B.邻接法

  C.最大似然法

  D.PAUP

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• 6假如你有两条远相关的蛋白。为了比较它们，最好使用下列哪个BL0SUM和PAM矩阵

  A.BLOSUM45或PAM250

  B.BLOSUM45或PAM1

  C.BLOSUM80或PAM250

  D.BLOSUM10或PAM1

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• 7与PAM打分矩阵比较，BL0SUM打分矩阵的最大区别在哪里

  A.它最好用于比较相关性很近的蛋白

  B.它是基于近相关蛋白的全局多序列比对

  C.它基于远相关蛋白的局部多序列比对

  D.它结合了局部和全局比对的信息

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• 8如果原先使用渐进多序列比对，则肯定可改进比对质量的措施是

  A.使用更多的序列

  B.修改软件的参数

  C.改用迭代法比对软件

  D.改用隐马尔科夫模型软件

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• 9基于一致性的比对方法的强项是

  A.它们包含了基于位置相关记分矩阵的信息

  B.它们包含了蛋白质的三维结构信息

  C.它们的速度非常快

  D.它们利用多序列比对过程中产生的信息来指导比对

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• 10基于结构的比对指的是

  A.仅凭序列的结构进行比对

  B.利用序列的结构信息进行比对

  C.用于比较序列相似而结构不相似的序列

  D.用于比较序列不相似而结构相似的序列

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